長江自北向東流過市境，北起與黃石接址的鄂州市楊葉鄉艾家灣，下迄陽新縣上巢湖天馬嶺，全長76.87公里。市境內由富水水系、大冶湖水系、保安湖水系及若干干流、支流和258個大小湖泊組成本地區水系。最大的水系為陽新境內的富水水系。富水河發源于通山，由西向東，流入長江 ，全長196公里，流域面積5310平方公里，在市境內河段長81公里，流域面積2245平方公里。大冶湖水系流域面積1339平方公里，保安湖水系流域面積570平方公里。市境內河港縱橫，湖泊、水庫星羅棋布，大小河港有408條，其中5公里以上河港有146條，總河長1732公里。湖泊258處，主要湖泊有11處，即：磁湖、青山湖、大冶湖、保安湖、網湖、舒婆湖、寶塔湖、十里湖、北煞湖、牧羊湖、海口湖，總承雨面積2469.76平方公里。水庫266座，總庫容25.05億立方米，全市水資源總量42.43億立方米，其中地下水資源量為8.05億立方米。